Protéomique et Spectrométrie de Masse des Biomolécules


Bioinformatique

 
La plate-forme s’est particulièrement investie depuis 2003 dans la mise en place et le développement d’un outil de gestion et de traçabilité des données à travers un LIMS (Laboratory Informatic Management System) répondant aux besoins de la plate-forme. Par ailleurs, devant l’absence d’outils suffisamment fiables dans la validation des données issues de la spectrométrie de masse nous développons, à partir d’un outil commercial ("Mascot File Parser"), un logiciel permettant d’accélérer la validation des résultats d'identification des protéines, en particulier à partir de mélanges complexes. Parallèlement, nous développons un outil informatique permettant de gérer efficacement les données quantitatives des approches utilisant des marquages isotopiques de type ICAT, SILAC ou 14N/15N.

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